Mistrz i Małgorzata to powieść o uczuciu, o miłości. Z elementami realistycznymi połączone są pierwiastki fantastyczne i baśniowe. Obecność wśród mieszkańców Moskwy czarownic, ogromnego kota, który potrafi mówić, a także szereg niesamowitych zjawisk przenikają się wzajemnie. Pojawia się także motyw kryminalny- wątek występujący na balu u Wolanda. Drugą warstwę stanowi wątek biblijny, opowieść o skazaniu Chrystusa na śmierć i przeżycia związane z decyzją Piłata pozwalają na sugestię, iż jest to powieść psychologiczna. Dzieło Bułhakowa można postrzegać także jako powieść paraboliczną, gdy wziąć pod uwagę, że stanowi przykład, pouczenie o losie człowieka egzystującego między światem rzeczywistym i fantastyczno-mistycznym.